抗生素：适用于急性额窦炎的患者，可及时控制感染，防止发生并发症。
选用抗生素最好依据鼻内分泌物细菌培养和药敏试验结果而定，在未得到确切的检验依据前，医生一般会选用针对化脓性球菌（肺炎链球菌、溶血链球菌等）和杆菌（流感嗜血杆菌等）有效的抗生素，如阿莫西林或阿莫西林克拉维酸钾。长时间使用药物可有恶心、呕吐、腹泻等不良反应，对本类药物过敏者、淋巴细胞性白血病患者、淋巴瘤患者等人群禁用。
鼻用糖皮质激素：鼻用糖皮质激素具有强大的抗炎、抗水肿效应，无论病因是感染性还是变态反应性（机体对一些物质过于敏感，如动物皮毛、花粉等）的，病变范围轻还是重，局部糖皮质激素都可作为主要药物。本病患者常规会使用糖皮质激素喷雾治疗（比如糠酸莫米松鼻喷雾等），来控制鼻窦黏膜的炎症及水肿。不良反应包括头痛、鼻灼热感等。
抗组胺药物：可用于存在过敏因素的患者，有助于减轻鼻黏膜的水肿程度。常用药物有西替利嗪、氯雷他定等，长时间用药可有口干、头痛、恶心等不良反应。对本品过敏者、孕妇及哺乳期妇女等禁用。
减充血剂：能够减轻炎症所致的充血和水肿。长期使用鼻腔减充血剂会对黏膜纤毛系统的形态与功能造成破坏，尤其是羟甲唑啉，麻黄碱等，因此需在医生指导下根据不同的病情酌情使用，一般不超过七天。
黏液稀释剂：如桉柠蒎肠溶胶囊、标准肠溶桃金娘油等，可稀释脓性分泌物，恢复黏膜纤毛的活性，有利于分泌物的排出和改善鼻腔黏膜环境的作用。不良反应轻微，偶有胃肠道不适（恶心、呕吐等）及过敏反应（皮疹、面部浮肿等），对本品过敏者禁用。